1953年成立郑州市隔离医院，1954年更名为郑州市传染病医院，1985年更名为郑州市第六人民医院。2001年与郑州市结核病防治所合并。2006年被原省卫生厅批准为“河南省传染病医院”。2021年3月，获批三级甲等医院。 2023年12月11日，成为郑州大学附属传染病医院、郑州大学传染病研究院。

经过70余年的发展，医院已发展成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的三级甲等传染病医院。

医院占地4.8万平方米，建筑面积7.7万平方米，学科建设科学规范，设置临床科室38个，医技科室16个。核定床位1460张，开放床位1300张，日住院人数1300余人。

全院现有在岗职工1700余人，卫生技术人员1478人，硕、博研究生254人，高级职称252人，国家级专家4人，国家级专业委员会副主任委员7人，省市学会主任委员16人。